gromacs
gromacs.editconf
gromacs.genion
gromacs.genrestr
gromacs.gmxselect
gromacs.grompp
gromacs.grompp_mdrun
gromacs.make_ndx
gromacs.mdrun
gromacs.pdb2gmx
gromacs.solvate
gromacs_extra
gromacs_extra.append_ligand
gromacs_extra.ndx2resttop